幻影忍者们在数码世界中遭遇重大危机，赞正面临着被电子黑暗之主删除记忆，再也不能醒来的危险！忍者们为了救回赞，进入了赞大脑中的数码世界，试图解开忍者之谜，在那里电子黑暗之王正利用忍者们的记忆攻击他们。幻影忍者们能否在共同的记忆中找到办法战胜电子黑暗之主，从而拯救赞呢？